Łącznie na terenie Gminy Swarzędz zlokalizowane są 4 przystanki kolejowe:
- Swarzędz i Paczkowo na trasie Poznań – Września,
- Ligowiec (Janikowo) i Kobylnica na trasie Poznań – Gniezno.
W końcu XIX wieku założono linie kolejową z Poznania do Wrześni i wtedy właśnie wybudowano dworzec kolejowy, wokół którego zaczęto budować osiedle, od tego czasu miasto zaczęło się rozbudowywać nieco w kierunku południowym, zwłaszcza wzdłuż obecnej ulicy Kórnickiej. Dworzec funkcjonuje do dziś.
W 2012 roku zarządca dworca kolejowego w Swarzędzu rozpoczął kompleksowy jego remont. Po jego zakończeniu, część pomieszczeń została przekazana samorządowi Swarzędza w celu zorganizowania tam gminnego centrum ratunkowego skupiającego służby pogotowia ratunkowego, straży miejskiej i straży pożarnej. Dworzec został uroczyście otwarty 14.02.2013 roku.
Kolejne inwestycje planowane w tym rejonie zmierzać będą do stworzenia zintegrowanego węzła komunikacyjnego łączącego parkingi buforowe, infrastrukturę komunikacji miejskiej oraz właśnie dworzec kolejowy z rozbudowaną ofertą połączeń kolejowych. W 2023 roku zakończono modernizację przejścia podziemnego, a na początku 2024 roku oddano do użytku kolejne miejsc parkingowych – tym razem po południowej stronie stacji.
Od 9 grudnia 2012 roku Przewozy Regionalne Sp. z o.o. (obecnie POLREGIO) wspólnie z Kolejami Wielkopolskimi Sp. z o. o. oraz Zarządem Transportu Miejskiego w Poznaniu wprowadziły nowy rodzaj biletu miesięcznego pod nazwą „Bus-Tramwaj-Kolej – Jeden Bilet„, który obowiązuje w pociągach regionalnych w promieniu ok. 30 km od Poznania oraz w tramwajach i autobusach komunikacji miejskiej organizowanej przez Zarząd Transportu Miejskiego w Poznaniu.
W 2018 roku urzeczywistnił się na terenie aglomeracji projekt Poznańskiej Kolei Metropolitalnej. Na liniach Poznań – Września oraz Poznań – Gniezno zwiększyła się częstotliwość kursowania pociągów.
Ciągłemu uzupełnianiu podlega infrastruktura dla podróżnych. W 2021 roku zakończył się kompleksowy remont dworca kolejowego w Kobylnicy, co wraz z wybudowaną przez Gminę Swarzędz pozostałą infrastrukturą techniczną dla podróżnych stworzyło kolejny węzeł przesiadkowy. Dodatkowo oddane do użytku zostały parkingi i nowe przystanki w rejonie stacji Paczkowo.